Создана новая методика, благодаря которой разработка новых лекарств пойдет быстрее. Российские и французские ученые предложили методику трехмерного рентгеновского «сканирования» белковых молекул. Она работает в 50 раз быстрее существующих аналогов.
По словам Сергея Грудинина (МФТ, город Долгопрудный), новый метод «Pepsi-SAXS» проверен на большой выборке данных. Подтвердилось, что он не только работает в 50 раз быстрее, чем известные методы CRYSOL, FoXS и трёхмерный метод Цернике в SAStbx, но и не уступает им в точности.
Новая методика позволяет получать рентгеновские фотографии молекул без особой подготовки и внутри растворов и живых клеток. Но вычислительных мощностей для нее потребуется больше, чем для остальных видов рентгеновских «сканеров» на обработку данных только одного эксперимента уходило не менее 10 часов. Но ученые нашли способ упростить расчеты, используя особые математические функции, учитывающие то, как расстояние между разными типами атомов в белковой цепочке и характер их связи с молекулами воды влияет на то, как они рассеивают рентгеновское излучение.
Методика и дальше будет совершенствоваться. Однако уже сейчас видно, что благодаря ей можно много достичь. В частности, ускорить создание новых органических материалов, что поможет биологам начать выращивать искусственные органы.
